A todos nos ha pasado que tenemos el disco duro full con archivos repetidos y encontrar esos archivos y eliminarlos  es algo tedioso, no obstante, existen  programas que hacen esta sencilla tarea.
Duplicate Cleaner: Sencillo programa que  se encarga de localizar en la ubicación que especifiquemos cualquier tipo de coincidencia que pueda existir entre dos o más ficheros, ya sea ésta de nombre, tamaño, fecha o incluso contenido de los archivos.
DoubleKiller: este  programa analiza el disco duro o el directorio seleccionado por el usuario para encontrar todos los archivos que coincidan en tamaño y características. Elimina los ficheros duplicados para ahorrar espacio en disco.
Duplicate File Finder: su funcionamiento es simple: compara los ficheros byte a byte o mediante sus CRC (Códigos de Redundancia Cíclica). El porcentaje de acierto en sus búsquedas es del 99.99%.
Anti-Twin: puede realizar su análisis en una ruta específica, escaneando toda la estructura de carpetas de la misma, o bien realizar una comparación entre dos directorios cualquiera.
EasyDuplicateFinder: es una práctica y muy útil aplicación que detecta archivos duplicados (100% duplicados; mismo nombre, mismo contenido, en comparación binaria byte por byte).

NoClone esta herramienta se encargará de buscar todos los archivos duplicados que tengas en tu pc y los eliminará (jpg, gif, videos olvidados, canciones repetidas…), con la posibilidad de restaurar los archivos en caso de error.
DeadRinger  Permite realizar la búsqueda con varios algoritmos diferentes, además, permite la previsualización de los archivos de imágenes encontrados, permitiendo comprobar fácilmente si se trata realmente de un archivo duplicado o no.

CloneSpy es una herramienta que te ayuda a detectar y eliminar archivos duplicados, vacíos o idénticos pero de diferentes versiones, recuperando un montón de espacio libre en tu disco duro.